UV sistēmas ekonomiku nosaka šādi faktori: iekārtas izmaksas un kalpošanas laiks; elektriskā efektivitāte; sterilizācijas efekta samazināšanās pakāpe darbības laikā; elektroenerģijas izmaksas u.c. Ultravioletās dezinfekcijas sistēmas ekonomiskā analīze vēl nav nonākusi pie secinājuma. Ir daudz analīzes ziņojumu ar dažādiem secinājumiem. Ir viedokļi, ka ultravioletā dezinfekcijas ierīce patērē daudz elektroenerģijas, un iekārtu uzturēšana un izmaksas ir augstas. Attiecībā uz lielām sistēmām ieguldījumi iekārtās ir lielāki nekā ozona sistēmā, un ekspluatācijas izmaksas ir līdzīgas ozona ekspluatācijas izmaksām; bet nelielajai tīra ūdens ražošanas sistēmai ieguldījumi ir mazāki nekā ozona ierīcei. Ir arī viedokļi, ka ārstēšanas svariem ar tūkstošiem tonnu dienā vai vairāk UV dezinfekcijas sistēmas investīciju un darbības izmaksas ir ļoti izdevīgas, kas ir daudz zemākas nekā hlorēšanas un ozona dezinfekcijas izmaksas. Piemēram, ir analītiski dati, ka, būvējot nelielu dzeramā ūdens attīrīšanas iekārtu ar iedzīvotāju skaitu no 10 līdz 25 000, aptuvenā ultravioletā, hlora dioksīda un ozona dezinfekcijas izmaksu attiecība ir 1:4: (8-9), iedzīvotājiem, kas ir lielāki par 500 000 sociālajām organizācijām, izmaksu attiecība ir aptuveni 1:2,5:2,5.
Šajās izmaksu aplēsēs nav iekļautas papildu izmaksas par dezinfekcijas blakusproduktu un kriptosporu cistu izņemšanu, izmantojot ar UV starojumu nesaistītus dezinfekcijas procesus. Turklāt analīzes dati liecina, ka ultravioletās dezinfekcijas ieguldījumu un ekspluatācijas izmaksas ir zemākas nekā hlora dezinfekcijai, un dezinfekcijas izmaksas ir aptuveni puse no hlora izmaksām, bet atšķirība tiek samazināta, paplašinoties ūdens attīrīšanas skalai.
Francijā un bijušajā Padomju Savienībā ultravioletā dezinfekcija aprobežojās ar nelielām iekārtām. Izveidotā lielā iekārta bija ultravioleto lampu uzstādīšana sērijveidā filtrēta ūdens elektrotīklā. Amerikas Savienotajās Valstīs ultravioletā dezinfekcija ir ierobežota arī ar nelielu aprīkojumu un peldbaseiniem, un to bieži apvieno ar citiem dezinfekcijas līdzekļiem. Tomēr praktiskos pielietojumos ziņots, ka dzeramā ūdens augu, kas izmanto ultravioleto dezinfekciju, mērogs pārsniedzis 1,5 miljonus tonnu dienā.